MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Erwinia amylovora ATCC 49946 plasmid 2

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013973	CGC	2	6	330	335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_013973	AGA	2	6	421	426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013973	TTG	2	6	457	462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013973	C	6	6	506	511	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_013973	T	6	6	1727	1732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013973	C	10	10	1780	1789	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_013973	TTC	2	6	2142	2147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013973	TGC	2	6	2301	2306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013973	GTC	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013973	CAC	2	6	2335	2340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_013973	ATG	2	6	2394	2399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013973	TA	3	6	2402	2407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013973	AC	3	6	2664	2669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013973	CCGC	2	8	4689	4696	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_013973	GCCT	2	8	4698	4705	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013973	C	6	6	4706	4711	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_013973	CTAC	2	8	4805	4812	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013973	GCG	2	6	5113	5118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013973	CGT	2	6	5124	5129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013973	GA	3	6	5141	5146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013973	TGA	2	6	5165	5170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013973	ATG	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013973	AT	4	8	5257	5264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013973	TGG	2	6	5270	5275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013973	GATG	2	8	5277	5284	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013973	ATT	2	6	5328	5333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013973	AAT	2	6	5465	5470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013973	TAA	2	6	5551	5556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013973	TAAG	2	8	5782	5789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013973	CTGA	2	8	6130	6137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013973	TTA	2	6	6140	6145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013973	TTA	2	6	6148	6153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013973	TTA	2	6	6156	6161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013973	TTA	2	6	6164	6169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013973	TAA	2	6	6173	6178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013973	CCT	2	6	7126	7131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_013973	ATGTT	2	10	7144	7153	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013973	AAC	2	6	7162	7167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013973	ACA	2	6	7179	7184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013973	ATG	2	6	7206	7211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013973	AAC	2	6	7219	7224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013973	TAA	2	6	7275	7280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013973	TTA	2	6	7316	7321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013973	TTA	2	6	7324	7329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013973	TTA	2	6	7332	7337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013973	TTA	2	6	7340	7345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013973	CTGTA	2	10	9077	9086	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_013973	TACAG	2	10	9093	9102	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013973	ATTTAC	2	12	9126	9137	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013973	TTAA	2	8	9189	9196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013973	AAT	2	6	9214	9219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013973	GTG	2	6	9233	9238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013973	TATT	2	8	9244	9251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013973	AGCG	2	8	10681	10688	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013973	GAG	2	6	11195	11200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013973	GCGGCC	2	12	12141	12152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013973	CCT	2	6	12734	12739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_013973	CAA	2	6	12768	12773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013973	TAA	2	6	12776	12781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013973	CTC	2	6	12795	12800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_013973	GTGCC	2	10	12848	12857	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_013973	CCG	2	6	12919	12924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_013973	CGG	2	6	12947	12952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013973	CTGT	2	8	12977	12984	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013973	TG	3	6	13002	13007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013973	GAG	2	6	13043	13048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013973	GCG	3	9	13773	13781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013973	G	6	6	14467	14472	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013973	GCG	2	6	14525	14530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013973	CTGA	2	8	14540	14547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013973	CTT	2	6	14971	14976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013973	GGC	2	6	14992	14997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013973	A	7	7	15006	15012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013973	GGC	2	6	15052	15057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013973	CGC	2	6	15291	15296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_013973	TGC	2	6	15318	15323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013973	AAC	2	6	15782	15787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013973	GGC	2	6	15790	15795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013973	ATG	2	6	16048	16053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013973	C	6	6	16279	16284	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_013973	GCA	2	6	16289	16294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013973	ACG	2	6	16346	16351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013973	A	6	6	16352	16357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013973	CCCG	2	8	16421	16428	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_013973	CG	3	6	16517	16522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013973	GA	3	6	17367	17372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013973	GCC	2	6	19374	19379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_013973	GGC	2	6	19386	19391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013973	GTC	2	6	19763	19768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013973	GCC	2	6	19794	19799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_013973	CCG	2	6	19805	19810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_013973	TGCC	2	8	19829	19836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013973	TCCGT	2	10	19933	19942	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_013973	GGT	2	6	19990	19995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013973	G	6	6	20003	20008	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013973	T	6	6	20565	20570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013973	CGGGA	2	10	21301	21310	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_013973	TGC	2	6	21320	21325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013973	CTCC	2	8	21338	21345	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_013973	CGG	2	6	21378	21383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013973	CT	3	6	21405	21410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013973	TC	3	6	21415	21420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013973	GTC	2	6	21509	21514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013973	GCC	2	6	21540	21545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_013973	CCG	2	6	21551	21556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_013973	TGCC	2	8	21575	21582	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013973	GCC	2	6	21660	21665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_013973	TCC	2	6	21703	21708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_013973	CCG	2	6	21766	21771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_013973	CGC	2	6	21798	21803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_013973	TCG	2	6	21840	21845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013973	CT	3	6	21858	21863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013973	TCG	2	6	21864	21869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013973	GAA	3	9	21907	21915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013973	CG	3	6	21946	21951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013973	CAGG	2	8	21975	21982	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013973	CGG	2	6	22559	22564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013973	GCTG	2	8	22574	22581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013973	TCA	2	6	22584	22589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013973	GC	3	6	22728	22733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013973	AG	3	6	23339	23344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013973	A	6	6	23352	23357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013973	CGT	2	6	23370	23375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013973	GAA	2	6	23466	23471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013973	CGT	2	6	23544	23549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013973	GGC	2	6	23558	23563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013973	AAT	2	6	23625	23630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013973	CTG	2	6	24026	24031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013973	ACC	2	6	24039	24044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_013973	A	6	6	24119	24124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013973	AAC	2	6	26623	26628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013973	AGG	2	6	26635	26640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013973	AACT	2	8	27213	27220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013973	TGT	2	6	27292	27297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013973	ATTAT	2	10	27305	27314	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013973	GTA	2	6	27661	27666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013973	T	7	7	27680	27686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013973	AAC	2	6	27746	27751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013973	TTA	2	6	27759	27764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013973	CT	3	6	27781	27786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013973	TTG	2	6	28158	28163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013973	TGA	2	6	29223	29228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013973	GCG	2	6	29318	29323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013973	T	7	7	29367	29373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013973	CGC	2	6	29399	29404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_013973	G	6	6	29435	29440	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013973	TCT	2	6	29554	29559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_013973	CGT	2	6	36697	36702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_013973	CTC	2	6	36706	36711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_013973	ATT	2	6	36721	36726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013973	GCG	2	6	36737	36742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_013973	CGC	3	9	37297	37305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_013973	CGG	2	6	37310	37315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_013973	GACT	2	8	37326	37333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_013973	ACT	2	6	40754	40759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_013973	T	6	6	40793	40798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013973	GCC	2	6	42834	42839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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160	NC_013973	ACA	2	6	55689	55694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_013973	CTC	2	6	55712	55717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_013973	CTT	2	6	55728	55733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_013973	AC	3	6	55754	55759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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174	NC_013973	GAT	2	6	71457	71462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.